近年来,基于高通量测序的基因组拷贝数变异测序技术(Copy Number Variation sequencing,CNV-seq)可对染色体数目异常、大片段缺失/重复及致病性拷贝数变异进行检测,在产前诊断、辅助生殖、儿科遗传病辅助诊断等领域得到了广泛应用。然而,由于CNV-seq技术本身无法实现对三倍体、单亲二倍体(uniparental disomy,UPD)的检测,一定程度上限制了其在流产原因排查和产前诊断中的应用,因此相关共识指南建议在使用CNVไ-seq技术的同时结合其他技术方法如STR分型或SNP分型用于三倍体和UPD的诊断,降低假阴性的风险。
为助力临床精准诊断,优发娱乐在常规CNV-seq检测范围的基础上进行优化升级,CNV-seq plus不仅能实现特定UPD检测、三倍体检测和母源污染排查,还能为临床提供本土化的CNV-seq解读报告系统,进一步助力临床提高诊疗效率。
01 更全面的检测范围提高染色体异常的检出率
优发娱乐在原有产品检测23对染色体非整倍体、100Kb以上缺失/重复的基础上,开发了独有的生物信息学算法并拥有完全自主知识产权(专利申请号:202010896507.5),升级版支持基因组纯合区域ROH检测,可提示10种>10Mb的致病性ROH;此外,通过联合STR/SNP分型技术,可实现三倍体异常和母源污染的检测,为临床提供更具性价比的检测产品。
CNV-seq plus检测范围
图1 优发娱乐基于CNV-seq测序数据检测多倍体和基因组纯合区域ROH的系统专利技术
02 更适用于临床的测序平台解决临床检测报告延期的问题
BES💃4000测序仪通量适中、兼容性强,支持不同项目标本如CNV-seq、NIPT、NIPT-plus等同批次上机测序,解决了等样凑样造成的报告周期延迟和试剂损耗等问题,支持临床机构自主开展检测项目。
BES4000高通量测序平台
03 更灵活的样本质控方案解决临床样本交叉污染鉴定的难题
优发娱乐自主开发了基于BES4000的SNP分型技术用于多倍体检测和母源污染鉴定,可以和CNV-seq同时上机检测和分析,为不具备STR分型设备即一代测序仪的实验室提供样本交叉污染鉴定的解决方案,解决了临床产前诊断标本、流产/引产组织等标本质控的难题。
04 更高效的实验操作解决实验操作繁琐的问题
优发娱乐CNV-seq plus大幅简化了建库流程,建库时间从5.6h降低至2.5h,时间和人力成本大幅降低。
升级版试剂盒的建库过程采用一管反应,既可避免转移过程中DNA量的损耗,也可减少反复转管导致的人为误差和交꧑叉污染。
05 更智能的数据分析系统解决数据精准解读的难题
算法更优化:升级版新增杂合性缺失检测算法,极大地提高了数据的信噪𒁏比和拷贝数变异检测的准确性;采用贝叶斯概率模型 (LOD值)对检测指标进行简化,🐻降低了人工审核的难度。
数据解读自动化:自建百万基因组🍸数据库和基于AI的智能报告系统,支持临床自主解读,极大地缓解了临床端的数据解读压力。
信息管理更灵活:实现样本录入、上机质控、💧注释解读、报告审核、报告生成一体化操作,实现全流程追溯,支持临床自主定制本土化报告方案。